Σάρωσαν τα μετάλλια οι ελληνικές ομάδες στον παγκόσμιο διαγωνισμό συνθετικής βιολογίας iGEM

Πέντε χρυσά, ένα αργυρό και δυο χάλκινα μετάλλια, αλλά και πολύ θαυμασμό κατάφερε να αποσπάσει η ελληνική συμμετοχή στον παγκόσμιο διαγωνισμό συνθετικής βιολογίας iGEM που ολοκληρώθηκε χθες στο Παρίσι. Όπως κάθε χρόνο έτσι και φέτος ομάδες προπτυχιακών, μεταπτυχιακών και διδακτορικών φοιτητών, αλλά και νέων ερευνητών από περισσότερες από 45 χώρες από όλες τις ηπείρους συγκεντρώθηκαν για να παρουσιάσουν στον τελικό “Giant Jamboree” πρωτοπόρα βιολογικά συστήματα με συγκεκριμένη αποστολή, κατασκευασμένα  με «εργαλεία» της συνθετικής βιολογίας. Η πρώτη συμμετοχή ομάδας ελλήνων φοιτητών στον διαγωνισμό ήταν το 2017 και φέτος έλαβαν μέρος 8 ομάδες από πολλά πανεπιστήμια της χώρας μας, οι οποίες παρουσίασαν τα παρακάτω ευφυή πρότζεκτ:

• Η iGEM Athens απέσπασε χρυσό μετάλλιο με το πρότζεκτ “AdAPTED: Augmenting dNTPs And Polymerase Through χρυσο Enzymatic Design”. Η ομάδα που απαρτίζεται φοιτητές της Σχολής Χημικών Μηχανικών του ΕΜΠ,  του Οικονομικού Πανεπιστημίου Αθηνών και του τμήματος  Βιολογίας του ΕΚΠΑ, προτείνει μια εναλλακτική προσέγγιση για την παραγωγή βασικών αντιδραστηρίων PCR, ένα βιολογικό σύστημα ικανό να παράγει dNTPs και DNA πολυμεράση, δηλ. δύο από τα σημαντικότερα αντιδραστήρια ενός τεστ PCR, διευρύνοντας έτσι την μαζική οικονομική πρόσβασή σε αυτά, αφού επιτρέπουν μια χαμηλού κόστους δοκιμή PCR, με εξαρτήματα που δεν απαιτούν αποθήκευση σε ψυχρό περιβάλλον. https://www.facebook.com/iGEM.Athens/
• Χρυσό και για τη iGEM NOUS, μια διεπιστημονική ομάδα φοιτητών από όλη την Ελλάδα, η οποία συμμετείχε ως Greece united με το πρότζεκτ “Epione: One Less Painful Step”. Η ομάδα επιχειρεί να καταπολεμήσει την οστεοαρθρίτιδα σταματώντας τον φλεγμονώδη κύκλο της με την εισαγωγή ειδικά επιμολυσμένων κυττάρων στην οστεοαρθριτική άρθρωση. Τα κύτταρα παράγουν συνθετικά σχεδιασμένα εξωσώματα που περιέχουν miRNA-140. Το miRNA-140 έχει αποδειχθεί ότι αναστέλλει την έκφραση ορισμένων καταστροφικών πρωτεϊνών του χόνδρου και προάγει την έκφραση αναγεννητικών παραγόντων. Δηλαδή η ομάδα προτείνει προσφέρει μια ανώδυνη θεραπεία χρησιμοποιώντας ένα συνθετικό βιολογικό σύστημα που παράγει ανασταλτικά miRNA. https://www.facebook.com/iGEMNous/
• Χρυσή και η iGEM Thessaloniki  με το πρότζεκτ “METIS: A toehold-based diagnostic tool for Pancreatic Ductal Adenocarcinoma”. Η ομάδα που αποτελείται από φοιτητές των Τμημάτων Ηλεκτρολόγων Μηχανικών και Μηχανικών Υπολογιστών, Χημείας, Πληροφορικής, Φαρμακευτικής, Φυσικής και Βιολογίας του ΑΠΘ, καθώς και από το τμήμα Μοριακής Βιολογίας και Γενετικής του ΔΠΘ αναπτύσσει ένα καινοτόμο in vitro διαγνωστικό για το αδενοκαρκίνωμα του παγκρέατος στα στάδια 1 και 2 μέσω της ανίχνευσης μικρών μορίων RNA στα ούρα ασθενών. Το αδενοκαρκίνωμα του παγκρεατικού πόρου (PDAC) είναι ο πιο κοινός τύπος καρκίνου του παγκρέατος και χαρακτηρίζεται από την καταστροφική έκβασή του, με ποσοστό 5ετούς επιβίωσης μόνο 10%. Όπως και σε άλλους τύπους καρκίνου, θεωρείται ότι η πρώιμη διάγνωση θα μπορούσε να συμβάλει σε μια πιο αποτελεσματική θεραπεία. https://www.facebook.com/iGEMthessaloniki
• Η iGEM Thessaly, που είναι μια διεπιστημονική ομάδα φοιτητών από το πανεπιστήμιο Θεσσαλίας, απέσπασε επίσης χρυσό μετάλλιο για το πρότζεκτ “Amalthea: a complete prevention toolkit to gut dysbiosis” στοχεύοντας στην ολοκληρωμένη ανάλυση του μικροβιώματος του εντέρου με σκοπό την πρόληψη ιδιοπαθών φλεγμονωδών νοσημάτων του και την παραγωγή εξατομικευμένων προτύπων διατροφής. Οι βλάβες στο μεταβολικό προφίλ του μικροβιώματος, που ονομάζεται δυσβίωση του εντέρου, χαρακτηρίζονται από μεταβαλλόμενες συγκεντρώσεις λιπαρών οξέων βραχείας αλυσίδας (SCFAs). Έτσι, η ομάδα αναπτύσσει μια βιοηλεκτρονική κάψουλα που χρησιμοποιεί έναν βιοαισθητήρα που συσχετίζει την ποσότητα των SCFA του εντέρου με τη λειτουργική ικανότητα του μικροβιώματος του εντέρου. Τα δεδομένα ψηφιοποιούνται και μεταδίδονται σε μια εφαρμογή για κινητά, όπου μια διεπιστημονική ομάδα εμπειρογνωμόνων υγείας τα αξιολογεί https://www.facebook.com/igemthessaly
• Στους χρυσούς και η iGEM Thrace με την “Salica: A device for early screening of colorectal cancer using salivary biomarkers” που στοχεύει στην μη παρεμβατική, οικονομική διάγνωση του καρκίνου του παχέος εντέρου, με ένα συνθετικό σύστημα που ανιχνεύει κατάλληλους βιοδείκτες στο σάλιο. Η προτεινόμενη λύση αφορά μια μη επεμβατική, εύχρηστη οικιακή συσκευή, που ποσοτικοποιεί με ακρίβεια τους βιοδείκτες του καρκίνου του παχέος εντέρου του σάλιου. Η iGEM Thrace είναι η διεπιστημονική ομάδα του Δημοκριτείου Πανεπιστημίου Θράκης, αποτελούμενη από φοιτητές του Τμήματος Μοριακής Βιολογίας και Γενετικής, αλλά και φοιτητές της Πολυτεχνικής Σχολής της Ξάνθης. https://www.facebook.com/igemthrace
• Η iGEM Crete απέσπασε το μοναδικό αργυρό μετάλλιο της ελληνικής αποστολής με το πρότζεκτ “A PLANT-BASED EDIBLE VACCINE EXPRESSING A CHIMERIC TRIPARTITE SPIKE-S1 PROTEIN OF SARS-CoV-2 FOR COVID-19 CONTROL”. Η ομάδα  σχεδιάζει μια συνθετική πρωτεΐνη η οποία θα παράγεται από φυτά και θα λειτουργεί ως εναλλακτική, βρώσιμη δόση εμβολίου κατά του SARS-CoV-2. Για να δημιουργήσει αυτό το εμβόλιο, σχεδίασε ένα συνθετικό γονίδιο που εκφράζει συγκεκριμένα αντιγόνα SARS-CoV-2 σε φυτικά κύτταρα. https://www.facebook.com/iGemCrete
• Η iGEM IOANNINA απέσπασε το ένα από τα δυο χάλκινα μετάλλια με το “Antibyeotic: Bacteria against AMRθέλει” και επιθυμεί να δώσει μια λύση στην συνεχώς αυξανόμενη μικροβιακή αντίσταση σε αντιβιοτικά, με την κατασκευή ενός βιολογικού, αυτοκαταστρεφόμενου συστήματος ικανού να εξουδετερώνει εναπομείναντα αντιβιοτικά. Η ομάδα σχεδιάζει έναν βακτηριακό μηχανισμό, ο οποίος μπορεί να αδρανοποιεί τις τετρακυκλίνες και τις μακρολίδες στο περιβάλλον, ενώ περιέχει έναν μηχανισμό αυτοκαταστροφής, ο οποίος ενεργοποιείται όταν εκπληρώσει το ρόλο του. https://www.facebook.com/igemioannina
• Το δεύτερο χάλκινο μετάλλιο ανήκει στην iGEM Patras και στο “PGasus: A comprehensive workflow for the identification & functional characterization of PGx variants” που στοχεύει στο λειτουργικό χαρακτηρισμό γενομικών παραλλαγών που έχουν προκύψει μέσω ενός φορητού αλληλουχητή επόμενης γενιάς, με στόχο την ενζυματική δραστηριότητα των ενζύμων CYP2D6 και CYP2C19, που είναι υπεύθυνα για το μεταβολισμό κλινικά χρησιμοποιούμενων φαρμάκων, με απώτερο σκοπό τη βελτιστοποίηση της φαρμακοθεραπείας του ασθενούς. .Η iGEM Patras είναι η διεπιστημονική ομάδα του πανεπιστημίου της Πάτρας, αποτελούμενη από φοιτητές του Τμήματος Φαρμακευτικής και  Βιολογίας και Γενετικής, αλλά και φοιτητές της Πολυτεχνικής Σχολής της Πάτρας. https://www.facebook.com/igempatras

Ο διαγωνισμός iGEM, ο οποίος υποστηρίζεται από τον ομώνυμο οργανισμό  iGEM (International Genetically Engineered Machine) που αποτελεί έναν μη κερδοσκοπικό οργανισμό με στόχο την προώθηση της συνθετικής βιολογίας, ξεκίνησε τον Ιανουάριο 2003 από το Massachusetts Institute of Technology (MIT) δίνοντας την ευκαιρία σε φοιτητές να αναπτύξουν τις δικές τους βιολογικές εφαρμογές. Το 2004 συμμετείχαν 5 ομάδες και το 2021 συγκεντρώθηκαν  περισσότερες από 350 με την υποστήριξη πανεπιστημίων, ερευνητικών κέντρων και community labs. Οι ομάδες που δηλώνουν συμμετοχή καλούνται να επιλύσουν  ένα πρόβλημα που αφορά μια από τις επόμενες κατηγορίες όπως ορίζονται από τον iGEM: diagnostics,environment,  food and nutrition, foundational advance, software, manufacturing, New application και therapeutics. Τα τελευταία 16 χρόνια, ο διαγωνισμός αυτός αποτελεί ορόσημο στον κλάδο της Συνθετικής Βιολογίας και πόλος έλξης πάνω από 350 ομάδων και 6000 φοιτητών ετησίως, ενώ από την έναρξή του το 2004, έχει φιλοξενήσει συνολικά πάνω από 40.000 φοιτητές, μαθητές και εκπαιδευτές ομάδων. Κάθε χρόνο σχεδόν 6.000 άνθρωποι αφιερώνουν το καλοκαίρι τους στο iGEM και στη συνέχεια συγκεντρώνονται το φθινόπωρο για να παρουσιάσουν τη δουλειά τους και να διαγωνιστούν στο ετήσιο Jamboree.

Περισσότερα για τον διαγωνισμό εδώ: https://igem.org/Main_Page